يختص المعهد باجراء البحوث والدراسات العلمية والتطبيقية في مجال الهندسة الصحية والبيئة وكذلك يقدم المعهد خدمات إجراء الإختبارات لصالح الجهات الخارجية ويشتمل مجال تخصص المعهد على دراسة المشاكل البيئية والإنشائية المتعلقة بسوء تنفيذ شبكات الصرف الصحي الداخلي والخارجي للمنشآت مع توضح أسباب حدوث الطفح لمياه الصرف الصحي وتأثير ذلك علي الهيكل الخرساني لهذه المنشآت وكذلك علي الصحة العامة وحالة المنشآت التي تم إصلاحها وتلافى العيوب بها بعد الإصلاح لوضع الحلول المناسبة لها وإجراء الإختبارات الروتينية للجهات الخارجية المختلفة المعنية بمياه الشرب والصرف الصحي والصرف الصناعي كما يقوم المعهد أيضاً بالمشاركة في إعداد الكودات والتدريب عليها في مجال الهندسة الصحية والبيئية